Assessment of the genetic structure of different families of Duroc pigs at loci of microsatellites

admin

UDC 636.082

S. Lugovoy, S. Kish.

To avoid future problems in agriculture and food industry, there is a clear need for significant efforts to conserve genetic resources. Development of effective mechanism for achieving this goal requires systematic monitoring of genetic processes in populations. In pig breeding as a tool for assessing biodiversity commercial, local and rare breeds are often use microsatellite polymorphism loci. In Ukraine is now are breeding 11 domestic and foreign breeds of pigs. In particular, created a new interbreed type of Ukrainian selection “Stepoviy”.
The aim of the research was to establish the genetic characteristics of various families of Duroc pigs on microsatellite DNA polymorphism loci. For the study we used data from the genetic polymorphism of 12 loci microsatellites of seven families of pigs Duroc, which are bred in a breeding plant PJSC “Pedigree farm “Stepoviy” Zaporozhye region. In the context of families, the number of animals was: Rosynka – 16 animals, Liliya – 7 animals, Muzyla – 11 animals, Romashka – 14 animals, Avgusta – 12 animals, Vishnya – 8 animals, Gastela – 4 animals. The material for DNA extraction were tissue samples (ear notching) of pigs. Preservative were performed as 96% ethanol. Laboratory studies were performed at the Center of biotechnology and molecular diagnostics of the All-Russian Research Institute of animal breeding of the RAAS.
It is established that different families of Duroc pigs are characterized by some specific features of the genetic profiles of genetic loci microsatellite DNA profiles. Evidence of this is the presence of private alleles, as well as differing degrees of heterozygosity. The most genetically differentiated among themselves have families of Gastelas and Liliyas, and most similar – Romashkas and Rosynkas. Peculiarities of the allelic profiles of each of the families can be the basis for the definition of marker alleles that could be used in further in-depth breeding, and genetic identification and confirmation of animal origin.

Key words: pig breeding, breeding, breeding records, information systems.

S. Lugovoi, S. Kish. Assessment of the genetic structure of different families of Duroc pigs at loci of microsatellites.

References:

  1. Ly Ch. Vvedenye v populiatsyonnuiu henetyku / Ch. Ly. — M. : Nauka, 1978. — 356 s.
  2. Lykhach V. Ya. Produktyvni yakosti svynei vnutrishnoporidnoho typu porody diurok ukrainskoi selektsii «Stepovyi» / V. Ya. Lykhach, O. M. Romanova // Tekhnolohiia vyrobnytstva i pererobky produktsii tvarynnytstva : zb. nauk. prats Bilotserk. derzh. ahrar. un-t. — Bila Tserkva, 2010. — Vyp. 3 (72). — S. 21—22.
  3. Luhovyi S. I. Otsinka vnutrishnoporodnoi minlyvosti svynei porody diurok za lokusamy mikrosatelitiv DNK / S. I. Luhovyi // Visnyk Zhytomyrskoho natsionalnoho ahroekolohichnoho universytetu. — 2013. — Vyp. # 1. (35) — T. 2 — S. 105—113.
  4. Luhovoi S. Y. Kharakterystyka henofonda miasnykh porod svynei ukraynskoho proyskhozhdenyia po lokusam mykrosatellytov DNK / S. Y. Luhovoi // Vestnyk Kazanskoho HAU. — Kazan, 2013. — # 2 (28). — S. 126—129.
  5. Metodycheskye rekomendatsyy po yspolzovanyiu metoda polymeraznoi tsepnoi reaktsyy v zhyvotnovodstve / [N. A. Zynoveva, A. N. Popov, L. K. Еrnst y dr.]. — Dubrovytsy : VYZh, 1998, — 47 s.
  6. Topikha V. S. Nove selektsiine dosiahnennia v Ukraini – Vnutrishnoporodnii typ svynei porody diurok «Stepovoi» / V. S. Topikha, A. A. Volkov // Zb. nauk. prats Kharkivskoi derzhavnoi zooveterynarnoi akademii : Silskohospodarski nauky. — Kh. : RVV KhDZVA, 2007. — Vyp. 15(40). — Ch. 1. — S. 25—30.
  7. Topikha V. S. Rezultaty pleminnoi roboty z vnutrishnoporidnym typom svynei porody diurok ukrainskoi selektsii «Stepovyi» v umovakh PAT «Plemzavod «Stepnoi» Zaporizkoi oblasti / V. S. Topikha, V. Ya. Lykhach, S. V. Kish // Visnyk ahrarnoi nauky Prychornomoria. — Mykolaiv : MNAU, 2014. — Vyp. 3, T(2). — S. 158—167.
  8. Kawasaki E. S. Sample preparation from blood, cells and other fluids. In PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications / Edited by M. A. Innis, D. H. Gelfand, J. J. Sninsky, T. J. White. — San Diego : Academic Press, 1990. — P. 146—152.
  9. Nei M. Genetic distance between populations / M. Nei // American Naturalist. — 1972. — №106 (949). — Р. 283-292.
  10. Nidup K. Genetic diversity of domestic pigs as revealed by microsatellites: a mini review / K. Nidup, C. Moran // Genomics and Quantitative Genetics. — 2011. — Vol. 2. — Р. 5—18.
  11. Peakall R. GenAIEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research – an update / R. Peakall, P. E. Smouse // Bioinformatics. — 2012. — V. 28. — P. 2537—2539.

С. И. Луговой, С. В. Киш. Оценка генетической структуры различных семейств свиней породы дюрок по локусам микросателлитов ДНК.

В статье приведены результаты оценки генетической структуры различных семейств свиней породы дюрок на основе полиморфизма локусов микросателлитов ДНК. Установлено, что разные семейства характеризуются определенной специфичностью аллельных профилей, которая может быть использована при дальнейшей углубленной племенной работе, а также для генетической идентификации и подтверждения происхождения животных.

С. І. Луговий, С. В. Кіш. Оцінка генетичної структури різних родин свиней породи дюрок за локусами мікросателітів ДНК.

У статті наведено результати оцінки генетичної структури різних родин свиней породи дюрок на основі поліморфізму локусів мікросателітів ДНК. Встановлено, що різні родини характеризуються певною специфічністю алельних профілів, яка може бути використана при подальшій поглибленій племінній роботі, а також для генетичної ідентифікації та підтвердження походження тварин.