Особливості генетичної структури південної м’ясної породи худоби за локусами мікросателітів ДНК: TGLA53, TGLA122, TGLA126 та TGLA227

УДК 575.827: 636.2.033

О. С. Крамаренко, кандидат сільськогосподарських наук
І. В. Довгопола, здобувач вищої освіти
Миколаївський національний аграрний університет

Досліджено генетичну структуру південної м’ясної породи худоби, що утримується в ДП ДГ «Асканійське» НААН, з використанням мікросателітів ДНК. Вперше було встановлено розподіл та частоту taurus/indicus-специфічних алелів серед особин низько- та висококровного підтипів. Три алеля (TGLA122149, TGLA126123 та TGLA22777) розглядаються як діагностичні для зебу, а три інші (TGLA53156, TGLA122143 та TGLA126115) – як діагностичні для різних порід ВРХ.

Ключові слова: ікросателіти ДНК, генотипове та алельне багатство, taurus/indicus-специфічні алелі, південна м’ясна порода, велика рогата худоба.

Особливості генетичної структури південної м’ясної породи худоби за локусами мікросателітів ДНК: TGLA53, TGLA122, TGLA126 та TGLA227. (текст статті)

Peculiarities of genetic structure of the Southern meat cattle breed were based on the microsatellite DNA of loci: TGLA53, TGLA122, TGLA126 and TGLA227. (анотація)

Список використаних джерел:
1. Аналіз генетичного поліморфізму за локусами мікросателітів худоби південної м’ясної породи / [О. С. Крамаренко, О. О. Гладир, В. О. Найдьонова та ін.] // Збірник наукових праць Подільського державного аграрно-технічного університету. – Кам’янець-Подільський : ПДАТУ, 2015. – Вип. 23. – С. 382–390.
2. Вейр Б. Анализ генетических данных / Б. Вейр. – М.: Мир, 1995. – 399 с.
3. Зиновьева Н. А. Генетическая экспертиза сельскохозяйственных животных: применение тест-систем на основе микросателлитов / Н. А. Зиновьева, Е. А. Гладырь // Достижения науки и техники АПК. – 2011. – № 9. – С. 19–20.
4. Крамаренко О. С. Аналіз генетичної диференціації за локусами мікросателітів худоби південної м’ясної породи / О. С. Крамаренко // Зб. наукових праць «Технологія виробництва і переробки продукції тваринництва». – Біла Церква : Білоц. нац. аграр. ун-т, 2015. – Вип. 1 (116). – С. 31– 35.
5. Крамаренко О. С. Аналіз генетико-демографічних процесів в популяції худоби південної м’ясної породи / О. С. Крамаренко // Вісник аграрної науки Причорномор’я : Зб. наукових праць Миколаївського національного аграрного університету. – Миколаїв : Микол. нац. аграр. ун-т, 2015. – Вип. 1 (82). – С. 203–209.
6. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве / [Н. А. Зиновьева, А. П. Попов, Л. К. Эрнст и др.] – Дубровицы: ВИЖ, 1998. – 47 с.
7. М’ясне скотарство в степовій зоні України / [Ю. В. Вдовиченко, В. І. Вороненко, В. О. Найдьонова та ін.] – Нова Каховка: ПИЕЛ, 2012. – 307с.
8. Allele frequencies of microsatellite loci for genetic characterization of a Sicilian bovine population / [M. Cosenza, S. Reale, T. Lupo et al.] // Genetics and Molecular Research. – 2015. – V. 14. – P. 691–699.
9. A microsatellite survey of cattle from a centre of origin: the Near East / [R. T. Loftus, O. Ertugrul, A. H. Harba et al.] // Molecular Ecology. – 1999. – V. 8. – P. 2015–2022.
10. Analysis of genetic diversity and population structure within the Icelandic cattle breed using molecular markers / [M. G. Asbjarnardottir, T. Kristjansson, M. B. Jonsson et al.] // Acta Agriculturae Scandinavica, Section A : Animal Science. – 2010 – V. 60(4). – P. 203–210.
11. Determination of ancestral proportions in synthetic bovine breeds using commonly employed microsatellite markers // [H. M. Bicalho, C. G. Pimenta, I. K. Mendes et al] // Genetics and Molecular Research. – 2006. – V. 5. – P. 432–437.
12. Establishment of an individual identification system based on microsatellite polymorphisms in Korean Cattle (Hanwoo) / [D.-H.Yoon, H.-S.Kong, J.-D.Oh et al.] // Asian-Australasian Journal of Animal Sciences. – 2005. – V. 18. – P. 762–766.
13. Genetic diversity, introgression and relationships among West/Central African cattle breeds / [E. M. Ibeagha-Awemu, O. C. Jann, C. Weimann et al.] // Genetics Selection Evolution. – 2004. – V. 36. – P. 673–690.
14. Genetic characterization of autochthonous cattle breeds, Cika and Busha, using microsatellites / [M. Simcic, M. Cepon, S. Horvat et al.] // Acta agriculturae Slovenica. – 2008. – Suppl. 2. – P. 71–77.
15. Genetic characterization of Colombian Brahman cattle using microsatellites markers / [Y. Gomez, M. Fernandez, D. Rivera et al.] // Russian Journal of Genetics. – 2013. – V. 49. – P. 737–745.
16. Genetic variability of the Zebu cattle breed (Bos indicus) in the department of Huila, Colombia using microsatellite molecular markers / [H. Escobar, O. Angel, O. Alfonso et al.] // Acta biologica Colombiana. – 2009. – V. 14. – P. 173–180.
17. Hammer O. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis / O. Hammer, D. A. T. Harper, P. D. Ryan // Palaeontologia Electronica. – 2001. – V. 4. – P. 1–9.
18. Janik A. Identification of polymorphism at 11 microsatellite loci in Hereford cattle / A. Janik, T. Zabek, A. Radko // Medycyna Weterynaryjna. – 2002. – V. 58. – P. 867–870.
19. Kundrat R. Hodnocení genetické diverzity u plemen skotu v ČR / R. Kundrat// MS thesis, Mendel University in Brno, Brno 2007. – 81 p.
20. Microsatellite DNA polymorphism and its usefulness for pedigree verification in Simmental cattle from Serbia / [J. Stevanovic, Z. Stanmirovic, V. Dimitrijevic et al.] // Acta Veterinaria. – 2009. – V. 59. – P. 621–631.
21. Molecular characterization of Bulgarian livestock genetic resources, II: Microsatelite variation within and among Bulgarian cattle breeds / [A. Teneva, E. Todorovska, N. Tyufekchiev et al.] // Biotechnology in Animal Husbandry. – 2007. – V. 23. – P. 227–242.
22. Molecular genetic characterization of punganur cattle / [P. C. Kesvulu, G. N. Rao, A. S. Niyaz ahmed et al.] // Tamilnadu Journal of Veterinary & Animal Sciences. – 2009. – V. 5. – P. 179–185.
23. Liron J. P. Genetic characterization of Argentine and Bolivian Creole cattle breeds assessed through microsatellites / J. P. Liron, P. Peral-García, G. Giovambattista // Journal of Heredity. – 2006. – V. 97. – P. 331–339.
24. Novoa M. A. Population genetic analysis of the Brahman cattle (Bos indicus) in Colombia with microsatellite markers / M. A. Novoa, W. Usaquen // Journal of Animal Breeding and Genetics. – 2010. – V. 127. – P. 161–168.
25. Peakall R. GenAIEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research – an update / R. Peakall, P. E. Smouse // Bioinformatics. – 2012. – V. 28. – P. 2537–2539.
26. Sifuentes-Rincon A. M. Assessment of genetic structure in Mexican charolais herds using microsatellite markers / A. M. Sifuentes-Rincon, H. Puentes-Montiel, G. M. Parra-Bracamonte // Electronic Journal of Biotechnology. – 2007. – V. 10. – P. 492–499.
27. Utilization of a 17 microsatellites set for bovine traceability in Czech cattle populations / [L. Putnova, I. Vrtkova, P. Srubarova et al.] // Iranian Journal of Applied Animal Science. – 2011. – V. 1. – P. 31–37.

А. С. Крамаренко, И. В. Довгополая. Особенности генетической структуры южной мясной породы скота на основе локусов микросателлитов ДНК: TGLA53, TGLA122, TGLA126 и TGLA227.

Исследована генетическая структура южной мясной породы скота, который содержится в ДП ДГ «Асканийское» НААН (Херсонская область), с помощью микросателлитов ДНК. Впервые было установлено распределение и частота taurus/indicus-специфических аллелей среди особей низко- и высококровного подтипов. Три аллеля (TGLA122149, TGLA126123 и TGLA22777) рассматриваются как диагностические для зебу, а три другие (TGLA53156, TGLA122143 и TGLA126115) – как диагностические для различных пород КРС.

O. Kramarenko, I. Dovhopola. Peculiarities of genetic structure of the Southern meat cattle breed were based on the microsatellite DNA of loci: TGLA53, TGLA122, TGLA126 and TGLA227.

Genetic structure of the Southern meat cattle breed from the State Enterprise Experimental Farm “Askaniyske” NAAS (Kherson region) was investigated which was based on the microsatellite DNA loci. We report for the first time the distribution and the frequency of a taurine- and an indicine-specific alleles among SG- and ZB-subpopulations of the Southern Meat cattle breed was established. Three alleles (TGLA122149, TGLA126123 and TGLA22777) were classified as zebu diagnostic; on other hand, three other alleles (TGLA53156, TGLA122143 and TGLA126115) were classified as taurine breeds diagnostic.

Випуск №1 (93), 2017

Аналіз генетико-демографічних процесів в популяції худоби півден ної м’ ясної породи

Номер, рік
1(82), 2015
УДК 636.4:636.082:575.827

Автор
О. С. Крамаренко, аспірант
Наук. керівник – д.с.-г.н., професор Гиль М.І.
Миколаївський національний аграрний університет

Встановлено, що досліджена популяція худоби південної м’ясної породи залежить від дї генетико-демографічних процесв. Особливо їх негативна дя позначається на тваринах  низькокровного підтипу. Для цих тварин відмчається втрата деяких рідкісних алелей та про-яв ефекту«пляшкового горла», що призводить до підвищення рвня інбридингу.

Ключові слова
генетико-демографічні процеси, мікросателти, ефект«пляшкового горла», південна м’ясна порода.
(more…)

Аналіз динаміки живої маси корів південної м’ясної породи різних типів методом BLUP

Номер, том, частина, рік
4(75), 2, 1, 2013

УДК
636.082.25

Автор
О.С. Крамаренко, аспірант
Науковий керівник – д. с.-г. н., професор Гиль М.І.
Миколаївський національний аграрний університет, Україна

Анотація
У статті наведено результати аналізу динаміки генетичного тренду показників росту телиць південної м’ясної породи різних ліній й типів, отриманого на основі метода BLUP. При використанні аналізу головних компонент (РСА) було визначено основні закономірності генетичного тренду та визначено найкращі лінії у кожному типі.

Ключові слова
метод BLUP, ВРХ, південна м’ясна порода, генеалогічна лінія
(more…)