Аналіз Головних Компонент (РСА) ознак відтворення свиноматок великої білої породи

УДК 636.4.034 / 57.087.01

DOI: 10.31521/2313-092X/2019-2(102)-11

 

С. С. Крамаренко, доктор біологічних наук
ORCID ID: 0000-0001-5658-1244
О. С. Крамаренко, кандидат сільськогосподарських наук
ORCID ID: 0000-0002-2635-526Х
С. І. Луговий, доктор сільськогосподарських наук
ORCID ID: 0000-0001-6505-8105
А. В. Лихач, доктор сільськогосподарських наук
ORCID ID: 0000-0002-0472-6162
В. Я. Лихач, доктор сільськогосподарських наук
ORCID ID: 0000-0002-9150-6730
Миколаївський національний аграрний університет, Україна\

 

     У дослідженні були використані свині великої білої породи (ВБП), які утримувалися в умовах ТОВ «Таврійські свині» (Херсонська область, Україна). Три Головні Компоненти описували майже 80% структурних залежностей, що існують між вісьмома ознаками відтворення свиноматок ВБП. Загальна кількість поросят при народженні підвищувалася до 5-го опоросу, а потім знижувалася. Кількість поросят при відлученні була найвищою у свиноматок, які опоросилися в червні-вересні і найменшою – у свиноматок, які опоросилися взимку.

   Ключові слова: ознаки відтворення, Аналіз Головних Компонент, номер опоросу, сезон опоросу, свиноматки.

Аналіз Головних Компонент (РСА) ознак відтворення свиноматок великої білої породи
Principal Component Analysis (PCA) of the reproductive traits in the Large White sows

Список використаних джерел:

  1. Borges, V. F., Bernardi, M. L., Bortolozzo, F. P., & Wentz, I. (2005). Risk factors for stillbirth and foetal mummification in four Brazilian swine herds. Preventive Veterinary Medicine. 70(3-4), 165-176. doi: 10.1016/j.prevetmed.2005.03.003
  2. Canario, L., Cantoni, E., Le Bihan, E., Caritez, J.C., Billon, Y., Bidanel, J.P., et al. (2006). Between-breed variability of stillbirth and its relationship with sow and piglet characteristics. Journal of Animal Science. 84(12), 3185-3196. doi: 10.2527/jas.2005-775
  3. Fahmy, M. H., & Bernard, C. S. (1972). Interrelations between some reproductive traits in swine. Canadian Journal of Animal Science, 52(1), 39-45. doi: 10.4141/cjas72-004
  4. Franci, O., Pugliese, C., Bozzi, R., Acciaioli, A., & Parisi, G. (2001). The use of multivariate analysis for evaluating relationships among fat depots in heavy pigs of different genotypes. Meat Science, 58(3), 259-266. doi: 10.1016/S0309-1740(00)00163-7
  5. Gregory, N. G., & Whelehan, O. P. (1983). Skull shape in relation to carcass fatness in pigs. Journal of the Science of Food and Agriculture, 34(12), 1397-1403. doi: 10.1002/jsfa.2740341213
  6. Халафян А.А. (2007). STATISTICA 6. Статистический анализ данных. М.: Бином-Пресс.
  7. Hanenberg, E. H. A. T., Knol, E. F., & Merks, J. W. M. (2001). Estimates of genetic parameters for reproduction traits at different parities in Dutch Landrace pigs. Livestock Production Science, 69(2), 179-186. doi: 10.1016/S0301-6226(00)00258-X
  8. Hu, Y., Suzuki, T., Noguchi, G., Li, Y., Kitamura, Y., & Satake, T. (2007). Study on evaluation of carcass traits and pork quality using principal component analysis. Nogyo Shisetsu (Journal of the Society of Agricultural Structures, Japan), 37(4), 173-182.
  9. Imboonta, N., Rydhmer, L., & Tumwasorn, S. (2007). Genetic parameters for reproduction and production traits of Landrace sows in Thailand. Journal of Animal Science, 85(1), 53-59. doi: 10.2527/jas.2005-708
  10. Karlsson, A. (1992). The use of principal component analysis (PCA) for evaluating results from pig meat quality measurements. Meat Science, 31(4), 423-433. doi: 10.1016/0309-1740(92)90025-Y
  11. Крамаренко, С. С., Луговий, С. І., Лихач, А. В., Крамаренко, О. С., & Лихач, В. Я. (2018). Порівняльний аналіз відтворювальних ознак та кластерний аналіз свиней різних порід. Науковий вісник Львівського національного університету ветеринарної медицини та біотехнологій імені С. З. Ґжицького. Серія “Сільськогосподарські науки”, 20(84), 21-26. doi: 10.15421/nvlvet8404
  12. Крамаренко, С. С., Луговий, С. І., Лихач, А. В., Крамаренко, О. С., Лихач, В. Я., & Слободяник, А. А. (2019). Вплив генетичних та негенетичних факторів на відтворювальні ознаки свиноматок української м’ясної породи. Науковий вісник Львівського національного університету ветеринарної медицини та біотехнологій імені С. З. Ґжицького. Серія “Сільськогосподарські науки”, 21(90), 3-8. doi: 10.32718/nvlvet-a9001
  13. Leenhouwers, J. I., van der Lende, T., & Knol, E. F. (1999). Analysis of stillbirth in different lines of pig. Livestock Production Science. 57(3), 243-253. doi: 10.1016/S0301-6226(98)00171-7
  14. Leigh, A. O. (1977). Litter performance characteristics of pigs in tropical south-western Nigeria 1. Breed differences and effects of some non-genetic sources of variation. Animal Science, 24(3), 323-331. doi: 10.1017/S0003356100011831
  15. Love, R. J., Evans, G., & Klupiec, C. (1993). Seasonal effects on fertility in gilts and sows. Journal of Reproduction and Fertility. Supplement, 48, 191-206. PMID:8145204
  16. Okoro, V. M., Ogundu, U. E., Okani, M., Oziri, I., Eneowo, O., Olisenekwu, O. T., et al. (2015). Principal Component Analysis of Conformation and Blood Marker Traits at Pre-and Post-Weaning Stages of Growth in F2 Crossbred Nigerian Indigenous × Landrace Pigs. Animal Biotechnology, 26(4), 243-250.
  17. Ros-Freixedes, R., Sadler, L. J., Onteru, S. K., Smith, R. M., Young, J. M., Johnson, A. K., et al. (2014). Relationship between gilt behavior and meat quality using principal component analysis. Meat Science, 96(1), 264-269. doi:  10.1016/j.meatsci.2013.07.004
  18. Schwarz, T., Nowicki, J., & Tuz, R. (2009). Reproductive performance of Polish Large White sows in intensive production: effect of parity and season. Annals of Animal Science, 9(3), 268-277.
  19. Шебанін, В. С., Мельник, С. І., Крамаренко, С. С., & Ганганов, В. М. (2008). Аналіз структури популяцій. Миколаїв: Вид-во Миколаїв. держ. аграрн. ун-ту.
  20. Southwood, O. I., & Kennedy, B. W. (1991). Genetic and environmental trends for litter size in swine. Journal of Animal Science, 69(8), 3177-3182. doi: 10.2527/1991.6983177x
  21. Tantasuparuk, W., Lundeheim, N., Dalin, A.M., Kunavongkrit, A., & Einarsson, S. (2000). Reproductive performance of purebred Landrace and Yorkshire sows in Thailand with special reference to seasonal influence and parity number. Theriogenology, 54(3), 481-496. doi: 10.1016/S0093-691X(00)00364-2
  22. van Steenbergen, E. J. (1989). Description and evaluation of a linear scoring system for exterior traits in pigs. Livestock Production Science, 23(1-2), 163-181. doi: 10.1016/0301-6226(89)90012-2
  23. Zaleski, H. M., & Hacker, R. R. (1993). Effect of oxygen and neostigmine on stillbirth and pig viability. Journal of Animal Science, 71(2), 298-305. doi: 10.2527/1993.712298x
  24. Young, L. D., Johnson, R. K., & Omtvedt, I. T. (1977). An analysis of the dependency structure between a gilt’s prebreeding and reproductive traits. II. Principal component analysis. Journal of Animal Science, 44(4), 565-570. doi: 10.2527/jas1977.444565x
  25. Young, L. D., Pumfrey, R. A., Cunningham, P. J., & Zimmerman, D. R. (1978). Heritabilities and genetic and phenotypic correlations for prebreeding traits, reproductive traits and principal components. Journal of Animal Science, 46(4), 937-949. doi: 10.2527/jas1978.464937x.

         С. С. Крамаренко, А. С. Крамаренко, С. И. Луговой, А. В. Лихач, В. Я. Лихач. Анализ Главных Компонент (PCA) репродуктивных признаков свиноматок крупной белой породы

          В исследовании были использованы свиньи крупной белой породы (КБП), которые содержались в условиях ООО «Таврийские свиньи» (Херсонская область, Украина). Три Главные Компоненты описывали около 80% структурных зависимостей, существующих между восемью репродуктивными признаками свиноматок КБП. Общее количество поросят при рождении повышалось к 5-му опоросу, а затем снижалось. Число поросят при отъеме было наивысшим у свиноматок, которые опоросились в июне-сентябре и наименьшим у свиноматок, которые опоросились зимой.

          Ключевые слова: репродуктивные признаки, Анализ Главных Компонент, номер опороса, сезон опороса, свиноматки.

 

         S. Kramarenko, A. Kramarenko, S. Lugovoy, A. Lykhach, V. Lykhach. Principal Component Analysis (PCA) of the reproductive traits in the Large White sows

        The Large White (LW) pig population used for the present study is from a pig farm managed by ‘Tavriys’ki Svyni’ Ltd (Kherson region, Ukraine). Three principal components (PC) accounted for near 80% of the dependency structure existing among the eight reproductive traits in the LW sows. TNB in the LW sows increased to the 5th parity and then decreased. The number of weaned piglets was the highest in sows farrowed in June-September, and the lowest in sows farrowed in winter.

      Keywords: reproductive traits, Principal Component Analysis (PCA), parity, season of farrowing, sows.

 

Матеріал розповсюджується за ліцензією Creative Commons Attribution International CC-BY 

 

Повернутися до змісту

kramarenko

О. С. Крамаренко, С. С. Крамаренко, Н. І. Кузьмічова. Ентропійно-інформаційний аналіз ознак росту теплиць Південної м´ясної породи

УДК 636.2.034 / 57.087

DOI: 10.31521/2313-092X/2018-4(100)-13

О. С. Крамаренко, кандидат сільськогосподарських наук
ORCID ID:
0000-0002-2635-526Х
С. С. Крамаренко,
доктор біологічних наук
ORCID ID:
0000-0001-5658-1244
Н. І. Кузьмічова,
здобувач вищої освіти ступеня доктор філософії
ORCID ID:
0000-0002-5806-3851
Миколаївський національний аграрний університет, Україна

За допомогою дисперсійного та ентропійно-інформаційного аналізу вивчено вплив генотипових та паратипових факторів на ознаки росту 232 телиць південної м’ясної породи. Результати свідчать про вірогідний вплив генерації та віку телиць на їх живу масу. Крім того, встановлено вірогідну взаємодію між генерацією та віком, а також між генерацією, походженням та віком телиць. Найнижчі оцінки ентропії були відмічені для живої маси при народженні і вони не залежали ані від походження, ані від генерації телиць.

Ключові слова: ентропійно-інформаційний аналіз (ЕІА), ознаки росту, телиці, м’ясна худоба.

Ентропійно-інформаційний аналіз ознак росту теплиць Південної м´ясної породи (текст статті)
Entropy and information analysis of the growth traits in the Southern Meat cattle breed heifers (анотація)

Список використаних джерел:

  1. Крамаренко С. С.  Особенности  использования  энтропийно-информационного  анализа  для количественных признаков биологических объектов. Известия Самарского научного центра Российской академии наук.    Т. 7. № 1. С. 242-247.
  2. Крамаренко А. С., Кузьмичева Н. И., Крамаренко С. С. Анализ главных компонент ростовых признаков южной мясной породы скота. Stiinta agricola.  № 1. С. 126-131.
  3. Крамаренко С. С., Луговой С. И. Использование энтропийно-информационного анализа для оценки воспроизводительных качеств свиноматок. Вестник Алтайского государственного аграрного университета. 2013. Т. 9, № 107. С. 58-62.
  4. Лихач В. Я., Крамаренко С. С., Шебанін П. О. Використання ентропійно-інформаційного аналізу для оцінки відтворювальних якостей помісних свиноматок. Вісник аграрної науки Причорномор’я.    Вип. 1 (82).  С. 187-194.
  5. М’ясне скотарство в степовій зоні України / [Ю. В. Вдовиченко, В. І. Вороненко, В. О. Найдьонова та ін.]. Нова Каховка: ПИЕЛ, 2012. 307 с.
  6. Халафян А. А. STATISTICA 6: Статистический анализ данных.  Москва, 2007. 512 с.
  7. Патрєва Л. С., Крамаренко С. С. Ентропійний аналіз кількісних ознак для селекційної оцінки батьківського стада м’ясних курей. Розведення і генетика тварин.    Вип. 41. С. 149-154.
  8. Підпала Т. В., Крамаренко О. С., Зайцев Є. М. Використання ентропійного аналізу для оцінки розвитку ознак молочної худоби голштинської породи. Науковий вісник Львівського національного університету ветеринарної медицини та біотехнологій імені С. З. Гжицького.   Т. 20, № 84.  С. 3-8.
  9. Підпала Т. В. Застосування ентропійного аналізу для оцінки селекційних ознак молочної худоби / Т. В. Підпала, С. С. Крамаренко, С. О. Бондар // Вісник Сумського національного аграрного університету. Серія: Тваринництво. – 2016. – Вип. 7. – С. 89-93.
  10. Хвостик В. П. Ентропійний аналіз якісних показників яєць гусей створюваної диморфної популяції / В. П. Хвостик // Науковий вісник Львівського національного університету ветеринарної медицини та біотехнологій імені С. З. Ґжицького. – 2011. – Т. 13. – № 4(50). – Ч. 3. – С. 324-327.
  11. Detection of SNP effects on feed conversion ratio in pigs based on entropy approach / [A. Borowska, H. Reyer, K. Wimmers et al.] // Acta Fytotechnica et Zootechnica. – 2016. – V. 19(3). – P. 103-105.
  12. Detection of pig genome regions determining production traits using an information theory approach / [A. Borowska, H. Reyer, K. Wimmers et al.] // Livestock Science. – 2017. – V. 205. – P. 31-35.
  13. Bourdon R. M. Genetic, environmental and phenotypic relationships among gestation length, birth weight, growth traits and age at first calving in beef cattle / R. M. Bourdon, J. S. Brinks // Journal of Animal Science. – 1982. – 55(3). – P. 543-553.
  14. Use of entropy in the analysis of nominal traits in sheep / [A. Dobek, R. Steppa, Molinski et al.] // Journal of applied genetics. – 2013. – V. 54(1). – P. 97-102.
  15. Gregory K. E. Breed effects and heterosis in advanced generations of composite populations for growth traits in both sexes of beef cattle / K. E. Gregory, L. V. Cundiff, R. M. Koch // Journal of animal science. – 1991. – V. 69(8). – P. 3202-3212.
  16. Holland M. D. Factors affecting calf birth weight: a review / M. D. Holland, K. G. Odde // Theriogenology. – 1992. – V. 38(5). – P. 769-798.
  17. Análise de componentes principais para características de crescimento em bovinos de corte / [C. A. D. Souza Dantas Muniz, S A. D. Queiroz, A. D. S. Mascioli et al.] // Semina: Ciencias Agrarias. – 2014. – V. 35(3). – P. 1569-1576.
  18. Пелих В. Г. Ентропійний аналіз гетерогенності свиноматок різних напрямів продуктивності за показником вирівняності гнізд під час народження / В. Г. Пелих, І. В. Чернишов // Вісник аграрної науки. – 2014. – №. – С. 36-37.

 

А. С. Крамаренко, С. С. Крамаренко, Н. И. Кузьмичева. Энтропийно-информационный анализ ростовых признаков телок южной мясной породы

С помощью дисперсионного и энтропийно-информационного анализа было изучено влияние генотипических и паратипических факторов на признаки роста 232 телок южной мясной породы. Результаты свидетельствуют о достоверном влиянии генерации и возраста телок на их живую массу. Кроме того, установлено достоверное взаимодействие между генерацией и возрастом, а также между генерацией, происхождением и возрастом телок. Самые низкие оценки энтропии были отмечены для живой массой при рождении и они не зависели ни от происхождения, ни от генерации телок.

Ключевые слова: энтропийно-информационный анализ (ЕИА), признаки роста, телки, мясной скот

 

A. Kramarenko, S. Kramarenko, N. Kuzmichova. Entropy and information analysis of the growth traits in the Southern Meat cattle breed heifers

The relationships among growth traits in different ages of 232 heifers Southern Meat Cattle breed and genotype and environmental factors were studied using a multifactorial ANOVA, and additionally with a entropy and information analysis. A repeated measures ANOVA revealed significant main effects for generation and age of heifers. Additionally, there was a significant interaction between generation and age of heifers and between generation, origin and age of heifers. The lowest entropy values were associated with BW, which did not depend on heifer’s origin and generation.

Key words: entropy and information analysis (EIA), growth traits, heifers, beef cattle.

Повернутися до змісту

kramarenko.pdf
Size: 0.33